Iniziamo col dire che a tuttora non esiste ancora una classificazione definitiva dei funghi accettata da tutti. Ogni scuola micologica usa una propria classificazione che si differenzia dalle altre e che è altrettanto logica ed accettabile.
Molti studiosi attualmente sono concordi nel dividere il "Regno dei Funghi" nei seguenti grandi gruppi:

-- 1) Chytridiomycota: specie acquatiche a spore uni-flagellate ( si tratta della base evolutiva dei funghi da cui sono poi derivati tutti gli altri)

-- 2) Zygomycota: specie a spore non flagellate, con tallo cenocitico o sifonnato ( le cellule non sono separate da chiusure e numerosi nuclei coabitano in uno stesso "sifone")
Queste specie sono sovente molto piccole o addirittura microscopiche.
Qui vengono annoverati i:

------------- Mucorales ( ausiliari dell'industria chimica o farmaceutica e a volte parassiti ----------------------dell'uomo)

---- ---------Endogonales ( compagni endomicorrizici delle piante superiori, abbondanti nel
--------------suolo; giocano un ruolo importante nell'equilibrio biologico)

------------- Entomophthorales (parassiti di piante o di animali; a volte agenti della lotta
--------------biologica contro gli insetti nocivi)

-- 3) Ascomycota: specie che riproducono le loro spore di riproduzione sessuata all'interno della
--cellula fertile denomoinata "asco" ( questi funghi vengono chiamati comunemente
--Ascomiceti)

--4) Basidiomycota: specie che producono le loro spore di riproduzione sessuata all'esterno
--della cellula fertile denominata "basidio" , di forma generalmente clavata portante le spore
--all'estremità di piccole punte chiamate "sterigmi". (Questi funghi vengono cominemente detti
--"Basidiomiceti")